商貿港物流中心為自置物業,全面監管大樓的出入及保安情況。商貿港物流中心及運貨程序榮獲科技資產保護協會倉庫安保標準甲級認證 (TAPA (Class A)),確保為客戶提供最安全的倉庫及貨運服務。
商貿港物流中心裝設24小時網上運作的閉路電視,大樓範圍亦有專業保安駐守,並核對及紀錄訪客的身份資料,以察安全。自動監測系統設有電子入侵偵測功能,大樓亦設置金屬探測門以檢測所有隱藏的金屬物件。倉庫亦設有高價貨專區,妥善儲存客戶的高價貨品。